Cerkiew pw. Św. Jana Teologa w Chełmie jest wpisana do rejestru zabytków województwa lubelskiego. Wszystkie prace realizowane były pod nadzorem Wojewódzkiego Konserwatora Zabytków w Lublinie.

Prace remontowo-konserwatorskie zabytkowej cerkwi wraz z otoczeniem prowadzone były w ramach projektu „Chełm - rewitalizacja zabytkowej cerkwi p.w. Św. Jana Teologa wraz z otoczeniem” dofinansowanego z Regionalnego Programu Operacyjnego Województwa Lubelskiego na lata 2007-2013, Działanie 3.2 „Rewitalizacja zdegradowanych obszarów miejskich”. Zakres rzeczowy projektu obejmował remont cerkwi, m.in. izolacja i naprawa ścian fundamentowych, wymiana elementów konstrukcyjnych i pokrycia dachowego cerkwi, remont elewacji, wymiana stolarki okiennej i drzwiowej. Przeprowadzono rewitalizacją murowanego ogrodzenia cerkwi. Zieleń wokół cerkwi - drzewa oraz krzewy zostały poddane zabiegom pielęgnacyjnym, drzewostan został uzupełniony poprzez nasadzenia. W ramach kompleksowego remontu zagospodarowanie terenu cerkwi również poddano pracom remontowym, m. in. wykonano utwardzenie terenu.

Remontowana cerkiew jest obiektem zabytkowym, w związku z tym zastosowane technologie, materiały były dostosowywane do wymogów pozwoleń konserwatorskiego oraz budowlanego a także konsultowane z Wojewódzkim Konserwatorem Zabytków.